Querida G., entendo sua situação confusa. Em minha opinião, um aspecto que está dificultando as coisas é que seu amigo não sabe ainda o que ele quer da vida. Pelo que você conta, ele transmite mensagens misturadas de simples amizade em um momento e de interessante romântico em outro. Essa confusão dele vai acabar deixando você maluca!
Além disso, você me falou que ele é uma pessoa legal, que orou com você. Mas, você não disse se ele é verdadeiramente cristão, do tipo de que tem um compromisso suuuuper sério com Deus, uma caminhada diária com ele. Isso não tem a ver com ir ou não à igreja. Tem a ver com relacionamento com Cristo. Se você não nota esse tipo de envolvimento profundo com Deus na vida dele, nenhum relacionamento além de amizade tem futuro para vocês. E, mesmo que ele seja um cristão sério, não dá pra ficar nessa indefinição toda.
Meu conselho é que você converse com ele e proponha que vocês se afastem um do outro por um tempo (tipo, um ou dois meses). Não é pra acabar a amizade e não é para cortar todo o contato, mas é pra se falar menos (quem sabe uma ou duas vezes por semana em vez de todo dia) e cortar qualquer tipo de contato físico. O objetivo desse período é você buscar orientação clara de Deus para este momento. Não importa o que Deus tenha mostrado antes, ele precise lhe dar clareza para agora. Dedique esse tempo a oração, à leitura da Bíblia, a aproximar-se de Deus. Só ele pode lhe dar a sabedoria necessária para entender que rumo esse relacionamento deve ou não tomar. E, para que você consiga perceber a direção de Deus, precisa se afastar um pouco dessa situação toda, de modo a ter mais objetividade.
Gostaria de sugerir, ainda, alguns posts para você ler e refletir, que poderão ajudá-la a tomar decisões em relação a seu amigo:
http://depapocomasu.blog.br/relacionamentos/2018/07/afinal-o-que-e-namoro/
http://depapocomasu.blog.br/relacionamentos/2018/02/gosto-de-um-menino-que-nao-e-cristao-e-agora/
http://depapocomasu.blog.br/deus/2018/02/faq-5-como-me-aproximar-de-deus/
Fique bem quietinha no seu canto, peça para seu amigo lhe dar um espaço e um tempo para buscar direção de Deus e confie que o Senhor lhe mostrará o próximo passo! Lembre-se de que os planos dele para você são muito melhores do que qualquer coisa que você possa imaginar e deixe que ele traga clareza para essa situação!
E, sempre que quiser trocar uma ideia, é só passar aqui. Estamos à disposição!
Kisses,
Su